物流信息系统中三个子系统：

订单管理系统（OMS）

订单管理系统在客户需要产品并下订单时和客户最早产生联系。它是订单管理系统的前端。订单管理系统和仓库管理系统相互交流，核查产品的可得率。该信息又为判断供应网络中产品的位置，可得数量和预计送货时间提供依据。一旦产品可得信息得到客户的首肯，就要进行信用审核，OMS系统就和企业财务系统相联系审核客户的状况和信用。在订单被接受后，订单管理系统又会将产品分派到某订单下，指定生产地、扣减库存、在运输安排确定后准备发票。

仓库管理系统（WMS）

仓库管理系统要和订单管理系统相连接，这样销售部门就可以知道哪些产品可供销售。WMS是一个信息子系统，协助人管理类流经产品和储蓄在物流网络设施内的产品。系统中的主要内容包括：1）接受；2）入库；3）库存管理；4）订单处理和接货；5)运输准备。所有这些要素都出现在典型配送仓库的WMS系统内，但是在某些主要供长期或周转比较快的仓库，有些内容可能缺失。

WMS系统按照其内部规则，会在收到订单后，将所订购产品分解为需要作不同处理和拣货作业的组。可能按产品存放点的位置分组。某些产品只需很少的数量，不足一箱，有些产品则按整箱取货或者以托盘为单位拣货。还有一些药从处于不同的位置的安全区取货。每个区域拣货的方法不同，一次捡取所有货物有可能效率低下。WMS系统就可以将订单分解，采取有效的拣货方法，安排货物在仓库不同区域之间移动使得货物到达出站时可以组成完整的订单货物。

运输管理系统（TMS）

运输管理系统主要侧重于企业内向和外向运输管理，是物流管理系统必不可少的组成部分。运输管理系统的目标是帮助计划和控制企业的运输活动，这包括：1）运输方式的选择；2）拼货；3）安排运输路线和时间；4）处理投诉；5）货物跟踪；6）运费单审核。